29 Dic 2020

Análisis completo del transcriptoma del tejido muscular porcino



En cerdos, se ha realizado una intensa investigación con el fin de seleccionar marcadores genéticos, que podrían estar asociados con rasgos de producción importantes y pueden incluirse en el programa de cría.

Objetivo

El objetivo del presente estudio fue comparar todo el perfil de expresión génica del músculo semimembranoso de tres razas de cerdos que difieren en musculatura, rasgos de gordura y calidad de la carne.

Método y materiales

El análisis de la secuencia de ARN se realizó en 16 animales: cerdos Pietrain (5), Polish Landrace – PL (4) y Pulawska (7). La secuenciación del transcriptoma del tejido muscular ( m. Semimembranosus) se llevó a cabo en el sistema HiScanSQ (Illumina) con 50 ciclos de un solo extremo. La validación de los resultados obtenidos y la estimación exacta de la abundancia de la transcripción se realizó mediante el método de PCR en tiempo real .

El presente estudio mostró la expresión diferencial de 229 genes entre cerdos Pulawska y PL, y 87 entre Pulawska y Pietrain ( ≤0.05).

Resultados

La raza Pulawska se caracterizó por una expresión significativamente mayor de solo 9 y 43 genes en comparación con los cerdos Pietrain y PL, respectivamente. De acuerdo con la anotación funcional de los DEG, se propusieron varios genes nuevos que estaban involucrados en procesos como la biosíntesis de purinas y pirimidinas, el ciclo celular, el transporte de proteínas y el metabolismo.

Estos genes pueden ser potencialmente responsables del crecimiento y desarrollo de las células musculares, por otro lado, la sobrerregulación de genes implicados en procesos inmunes, observada en cerdos nativos de Pulawska, puede estar relacionada con una muy buena resistencia a enfermedades de esta raza.

El perfil de expresión diferente de genes seleccionados puede ilustrar el efecto de la selección a largo plazo para mejorar el contenido de carne en canales realizadas en cerdos.

Fuente: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1871141315300251




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